而崇祯皇帝对此也是冷眼旁观。这次温体仁的事做的也是太过分了一点，使得他对温体仁也有了看法。再怎么样，也不能动摇崇祯皇帝的统治，逼反一支官军的罪责总该要有人来承担吧！
毫无意外，见此好机会，曹化淳及时的落井下石了。
当曹化淳直接向崇祯皇帝请求：让他亲率东厂番役调查钱益谦之事，以杜绝小人诬陷大臣，搅乱朝政的歪风时。崇祯皇帝同意了。
于是曹化淳雷厉风行地抓了陈履谦和张汉儒，并且亲自在外东厂严刑拷讯。这大明十大酷刑一摆出来，陈履谦和张汉儒就把膝盖给献了出来，他们在进来的头天晚上，曹化淳第一次去审问的时候，就竹筒倒豆子般全交待了。除了交代本人作案情况外，连幕后主使首辅温体仁的诸多言行，也一并交代了。
而这些也不是屈打成招，都是事实，所以曹化淳也很容易地找到了相应的证据，形成了很完整的证据链。所以当曹化淳向崇祯皇帝一禀告，崇祯皇帝又见到并没有什么疑点，他就沉默了半天，最后说了句：“体仁有党！”
崇祯皇帝利用温体仁就是要打击东林党的，而现在竟然发现了温体仁自己都结党营私，于是温体仁的政治生命就进入了倒计时。
于是，崇祯皇帝先决定免除对钱谦益和瞿式耜的查处，并命将陈履谦和张汉儒交刑部议处。而恰巧刑部尚书郑三俊也是东林一党，于是再审肯定是别无异词，议定对陈、张二犯各杖责一百，枷号三月。两个人先是被打得个半死，接着又要扛上几十斤重的木枷连日在街头示众，加上刑部牢里毫不留情，三个月的期限未到就先后死了。
这个案子前前后后闹腾了将近半年的时间，一旦真象大白，东林党官员再次乘势不依不饶地追究起当初温体仁拟旨的过失来，而且把过去的一些是非也重新搬了出来。这时候的温体仁真有些墙倒众人推的味道啊！可是温体仁还是没料到，还有祸不单行呢。
在开春以后，山东总兵丘磊出海救援朝鲜，可船行半道，就得知朝鲜已经沦落，见自己的使命已经不可能完成，去援的明军只能够灰溜溜地返回了山东。
在崇祯九年的十二月，清军兵抵汉城，朝鲜京城是哭声震天，连朝鲜国王李倧逃亡的南汉山城也被清军包围了。三十日清军入朝鲜京城。第二年正月初四日，清军北渡汉江，距王京二十里驻营。
初七日，清军战胜朝鲜全罗、忠清两道援军，但是六十六岁的额驸扬古利被朝鲜一卒击中身亡。顺便说一句，那正是朝鲜的火铳手。而朝鲜李倧以“势穷情迫”为由，称臣请罪。
皇太极要求严惩朝鲜挑起衅端的大臣，也就是要杀亲大明的朝鲜大臣，同时造船发兵攻入江华岛，获朝鲜王妃、王子及阁臣等人。二十八日，李倧献出两祸首。
同一天皇太极提出：必须去掉明国年号，断绝与明交往，献出明国所与诰命册印；国王亲自来谒，以长子并另一子为质，诸大臣也以子弟为质，将来立其质子为嗣；从今以后一应文移，奉大清国为正朔，所有节日俱行贡献之礼。使臣往来均遵照明国旧例。
特别注意的是一点，皇太极还提出：当清军有事征伐明国时，调兵数目、日期，一切不误。皇太极看中了打死额驸扬古利的朝鲜火铳手了。
并且皇太极还让朝鲜当即备齐鸟枪、弓箭手及兵船五十艘，助攻皮岛；而当大军撤还时，欢送，俘获之人逃回执送本主；以后每年进贡一次，黄金百两，白银千两及皮张纸席等物均有定数。
三十日朝鲜国王李倧亲至皇太极面前伏地请罪。举行受降仪式后，当即留下其长子及次子为质，其余被俘妻子家口二百余人遣送还京。二月初二日，皇太极自朝鲜班师。从此清朝代替明朝把朝鲜变成了藩属。朝鲜对清朝由以前的兄弟之称，更执藩臣之礼。
不久阿济格领兵攻克皮岛，斩明将沈世魁等，彻底解除了清朝攻向关内的后顾之忧。
藩国朝鲜的丢失，又使得整个大明朝廷巨哗，除去战略上的考虑，大明朝又一次的大失了颜面，而崇祯皇帝也对温体仁的无能有些忍无可忍了，尤其是当他找到位，认为其是“宰辅之才”的杨嗣昌。
于是当温体仁照例引咎乞休时，温本人还以为会由皇帝来温旨慰留。而在内阁值班的张至发本来也按照以往的规律票拟了慰留之旨的。
谁知崇祯皇帝却在上面批了“放他去”三个字。毫无思想准备的温体仁正在家中吃饭，当他听到了这一消息，一时惊慌，竟然把手里的筷子也掉在地上了。
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